筛取vcf中的样品
$ bcftools view -S samplelist_vcf.txt all.vcf >snp/all_snp.vcf
samplelist_vcf.txt中按列排样本名即可
曾是bed文件
重命名，再转为bed文件
$ bcftools reheader -s rename_snp.txt snp/all_snp.vcf -o snp/new_all_snp.vcf && rm snp/all_snp.vcf &&
$ plink --file snp/new_all_snp --map3 --missing-genotype 0 --make-bed --out snp/new_all_snp
rename_snp.txt是一个两列文件，分别是旧ID和新ID
筛取bed中的样品
$ plink --allow-extra-chr -bfile all_SV_heter --keep samplelist.txt --recode --make-bed --out sv/all_sv
samplelist.txt也得是一个两列文件，FAMID和sampleID
重命名，转回vcf文件
还没搞清楚要怎么重命名
$ plink --bfile sv/new_all_sv --recode vcf --out sv/new_all_sv
转回vcf文件的必要性不大
