斑马鱼转基因载体与转基因鱼的命名

因为最近看到一个斑马鱼单细胞的文献,看实验部分的时候,看那斑马鱼品种看得我很懵逼,就索性了解下下咯
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264; Tg(foxd3:EGFP)zf104
Tg(tph2:mCherry)y227; Tg(gfap:EGFP)mi2001
刚开始的时候Tg我也不懂
后来百度了下
刚好看到有一个文献是讲这方面内容
文献名字是《斑马鱼突变体和转基因鱼系命名规则简介》

image.png

文献是Agouti-Related Protein 2 Is a New Player in the Teleost Stress Response System

1.命名原则

Tg-Trangene 转基因,
TgBAC/TgPAC表示用BAC或者PAC制备的转基因
转基因载体整合到斑马鱼基因组中造成的
转基因载体的标准表达式: Tg(promotor:gene)
Tg表示普通转基因,括号内则记录了该载体的最关键特征成分,包括调控元件(例如: 启动子)以及有编码功能的基因,两者用冒号隔开
连续的调控元件或者融合读码框之间用横线连接
受同一调控元件控制的独立读码框之间用逗号隔开
不同读码框受不同调控元件驱动,则采用多组"调控元件: 编码序列"的形式依次描述,用逗号分隔
作者给了个例子


例子

补充

2.阅读的文献里的转基因斑马鱼

TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264; Tg(foxd3:EGFP)zf104
作为一个小白,还去查了mCherry和EGFP是啥,真就这几个字母看了半天啊

Tg-Trangene缩写 表示转基因, TgBAC/TgPAC表示用BAC或者PAC制备的转基因载体
agrp2:Gal4-VP16 agrp2 转录本表达的启动子调控元件, Gal4-VP16 基因的读码框,tlv05表示该机构的鱼系标识。
Tg(foxd3:EGFP)zf104 foxd3转录本表达的启动子调控元件,EGFP基因的读码框

TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264;---为了拿到表达mCherry的Agrp2 pineal cells
Tg(foxd3:EGFP)zf104--为了拿到逼到EGFP 的 pineal neuron cells
Tg(tph2:mCherry)y227---为了拿到mCherry表达的pineal photoreceptors cells
Tg(gfap:EGFP)mi2001--为了拿到EGFP表达的astrocyte 和pineal interstitial cells 松果体间充质细胞

补充在后面

mCherry是一种被广泛用于生物技术作为示踪剂的红色荧光染料,包括分子的标记和细胞组分的定位等。不同于其它从维多利亚水母中分离的GFP蛋白和其它绿色荧光蛋白变体,mCherry以及其它大多数红色荧光蛋白是从珊瑚(Discosoma)中分离出来的蛋白。mCherry因为其颜色和单体分子的光稳定性,比其它荧光蛋白标签更优异,其最大激发光和发射光分别为587nm和610nm。

EGFP,即增强绿色荧光蛋白(Enhanced Green Fluorescent Protein),GFP,即绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein)。EGFP是GFP突变系,应用较多的是GFP的突变体:增强型绿色荧光蛋白(EGFP )(64位苯丙一亮),发射出的荧光强度比GFP大6倍以上。 绿色荧光蛋白,是一个由约238个氨基酸组成的蛋白质,从蓝光到紫外线都能使其激发,发出绿色荧光。虽然许多其他海洋生物也有类似的绿色荧光蛋白,但传统上,绿色荧光蛋白(GFP)指首先从维多利亚多管发光水母中分离的蛋白质。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 217,734评论 6 505
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,931评论 3 394
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 164,133评论 0 354
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,532评论 1 293
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,585评论 6 392
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,462评论 1 302
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,262评论 3 418
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 39,153评论 0 276
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,587评论 1 314
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,792评论 3 336
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,919评论 1 348
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,635评论 5 345
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,237评论 3 329
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,855评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,983评论 1 269
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 48,048评论 3 370
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,864评论 2 354

推荐阅读更多精彩内容