初始的崇拜
试想一个我们遥远的先祖，夜晚躲在一个较隐蔽的洞穴里睡觉。随着月亮在轨道上运行，这只发光眼睛出现在洞穴的入口，月光照进洞里，吓醒了这个原始人。或许，这强烈神秘的感觉刺激到了他，于是他捡起一根骨头和石头，潦草地画下第一个书写记录。
一万年后，在乌克兰的哥齐寻找上古遗迹的考古学家，发现了他在长毛象的象牙上雕刻了一些记号，画出了月亮的相位与运动。
这是人类祖先在蒙眛期，开始觉醒，产生了对自然强大力量的认识和崇拜。这是人类崇拜神明的混沌期。
神学的理论化
如果说在荒原中，你看到了一块石头，你会认为这块石头一直就在那里，是自然存在的。但如果你看到一块钟表，有精密的机械装置，驱动着钟表的运行。你不会认识钟表与石头一样，是自然之物。而会知道一定是有个钟表匠设计并制造出来的，是有目的的。同样的推论到生物上，生物体看上去也复杂精密，一定是有人为了一个目的设计出来的，而设计者就应该是神。
演化，而不是进化
“进化”这个词的英文是evolution，本意是“演化”，拉丁词源是“展开”的意思。由于历史原因，被翻译成了进化，产生了一种进化是有方向的，是一直前进的错觉。认为进化就是从简单到复杂，从低级到高级的演变，是一种误解。其实演化是随机的，它朝哪个方向走都可以，谈不上进与退。这所以复杂的生命出现的越来越多，是因为生命是不可能无限简单的。也就是说，在简单这一侧，是有一面无法逾越的墙挡着。随机漫步，会在简单这一侧遇上极限，而无法更加简单。于是，看起来总的方向是趋于复杂。
在理解了进化的随机性后，我想提到一种算法——蒙特卡洛法。蒙特卡洛法曾被称为一种简单粗暴的解算方法，不需要推导解算，而是通过＂实验＂，通过随机打靶来找答案。每一次的结果都是随机的，就如同进化中的变异。而大量的随机后，会使得整体产生一个越来越准确的结果。就是这样一种简单的类似于进化的算法，在科学界取得了重大的应用。其首次应用就是在原子弹的计算上。
适者生存
为何是适者生存，而不是强者生存？肌肉发达，武功高强，不应该有更大的生存几率吗？
说明这个问题，举一个例子就够了。恐龙在当年，是名副其实的霸王，硕大的体型，强劲的力量，是当时的最强者。可它灭亡了，因为不能适应环境的骤变。而人类的祖先，远没有恐龙强大，却由于更强的适应性，生存了下来。并在这次契机下，取代了恐龙，成为了新的霸主。
进化是渐变的
进化总是在之前的基础上，而不是一次性设计出来的。也就是说，每一步的进化都要能适应了环境，适应了选择。不然就被淘汰了。而进化是在原基础上的变化，于是总有上一代的影子。
比如噎死曾是美国第六大死因。噎死的病因是什么？是食管和气管在嗓子底下这个部位二者交叉，偶尔会出现食物进入气管导致事故。如果二者各行其道，相互独立就不会发生了。可这不是一步到位设计出来的，而是漫长进化出来的，是进化过程中的遗留问题。进化总是不断产生适应性，却不是为了产生完美。
伟大的进化论
进化论是近代人类历史上最重要的科学发现之一。有了进化论，我们不再需要神明创造生命。进化论让我们能意识到，这一切可能并没有特定的目的，而只是几十亿年的时间累积。
