农杆菌主要有两种：根癌农杆菌和发根农杆菌（都是革兰氏阴性菌）
根癌农杆菌能在自然条件下趋化性地感染140多种双子叶植物或裸子植物的受伤部位
而发根农杆菌则诱导产生发状根，其特征是大量增生高度分支的根系
在革兰氏染色实验中，首先添加了龙胆紫（crystal violet），进行初染，然后添加碘液复染。第一步染色完成后，革兰氏阳性菌和阴性菌均被染为紫色。这时进行洗色（洗色的时间至关重要，是染色的关键，大约20~30秒），只有革兰氏阴性菌会被洗去颜色变为无色，而阳性菌仍为紫色。再添入另一种复染染料（通常使用番红（safranin）或品红（fuchsine）），从而将所有的革兰氏阴性菌染成红色或粉色，而阳性菌仍为紫色。通过这种测试我们可以区分这两种细胞壁结构不同的细菌。
