削藩行动正在如火如荼地进行。燕王坐不住了。
其实要说间隙，燕王和建文帝之间早就有了。
朱元璋在订立藩王制度时，有那么一条：不允许各亲王之间相互往来，即使入朝，也不能同时前来，必须一王离京，另一王才可启程。朱元璋此举的目的在于避免诸王相互串联，与朝廷相对抗。由此可见朱元璋为了保住皇位的良苦用心。
考虑到皇孙的实际情况，朱元璋去世前更是留有遗诏，不许诸王“入临、会葬”。 如果大家都凑齐了，保不准会出什么事儿。对于诸王来说，自己的爹死了，想看着他入土为安都不行。
但燕王朱棣仍旧选择直奔京师。建文帝朱允炆闻讯后，立刻派人持敕，令朱棣返回北平，朱棣对此十分不悦。
建文元年正月，朱允炆即位不久，燕王朱棣派遣长史葛诚去京师上奏事项。朱允炆乘机向葛诚秘密询问关于燕王府的动向，葛诚做了如实禀告。朱允炆命令葛诚返回燕王府后作为朝廷的内应，负责给他提供情报。
葛诚回到燕王府，朱棣见他神色不对，心中生疑。随后朱棣亲自入朝，他自恃皇叔的身份，走皇道入宫，且不对朱允炆进行跪拜。监察御史曾凤韶弹劾朱棣不敬，户部侍郎卓敬也密奏，建议将他徙封至南昌，但都被朱允炆以“骨肉至亲”，婉言拒绝。但此时的朱棣已有戒心。
朱元璋在分封诸子为藩王的成法中有一条是关于“靖难”的。为了防止权臣篡权，朱元璋规定藩王有移文中央索取奸臣和举兵清君侧的权利，他在《皇明祖训》中说：“朝无正臣，内有奸逆，必举兵诛讨，以清君侧。”
朱允炆当时宠信齐泰、黄子澄等人，正是听了他们建议才对诸王进行削藩。
朱棣与朝廷的矛盾激化后，声称齐泰、黄子澄为奸臣，须加诛讨，并称自己的举动为“靖难”，所以靖难之役中朱棣的口号是“清君侧，靖国难”。
那靖难是否就符合太祖皇帝的成法了呢？当然不是。成法里面还规定了一条：靖难要由皇帝先召唤藩王，藩王才能起兵，且成功铲除奸臣后要五日之内离京。所以，朱棣所谓的靖难，不过是他想要夺取皇位的一个借口而已。
其实严格来说，也不能说他就是为了皇位。如果不是削藩，朱棣可能不会那么快就萌生夺权。如果不反抗，自身难保。加上不安分的和尚姚广孝的添油加醋，本身就是刺头的朱棣决定起兵。
朱允炆和朱棣相比，差距还是有那么一些的。靖难之役持续了四年左右，最终以朱棣胜利、朱允炆下落不明告终。
随后，开启了永乐时代。
