作者，Evil Genius
参加过培训的学员应该对这个内容不陌生，现在我的教程盗版满天飞，不知道多少人学会了这个细胞等级的分析绘图方法，当时培训的时候称这个分析为cell degree，也叫细胞网络，不过时过境迁，很多代码都需要进行更新，老版很多在软件更新后就不能用了。
希望大家能够坚持正版，学到真东西，也要学会自我更新的能力。
大家同时也要参考高精度的意义，CosMx文献分享--空间同型聚类对癌细胞可塑性的抑制。
首先来复习一下cell degree的意义
细胞在空间位置上不是随机出现的，细胞在空间上的定位受到了周围环境以及自身状态的影响，而这种影响的结果，就是每种细胞类型在空间上形成了具有区域偏好性的细胞“网络”。为了系统的确定特定细胞类型的细胞区域“网络”,计算了每种细胞类别中的空间位置彼此相邻的倾向，这里我们称之为同型细胞“网络”。
同型细胞“网络”是为了确定单一细胞类型在空间上的分布特点，多条件进行比较会发现明显的差异和生物学变化。
为了评估每一类（这里就是细胞类型）中spot的空间聚类程度，针对空间转录组构建空间细胞网络，计算网络中每个点 i 的spot degree--- ki（即直接相邻spot的数量，对于 Visium 对应的最大spot degree为 6）。
意思就是一个spot含有细胞类型A，那其周围的6个spot如果都含有A，那么该spot 为等级6，5个spot含有A则是等级5，以此类推。
当然，对于阈值需要有一定的判断，含量过低的spot不能考虑为有效的degree。
我们来更新一下这个分析代码,实现这种degree分析
