气泡图-谢勇飞！代码有不全的地方，懒，不想写，使用的时候请自行修改，无基础别用

<span style="font-size: 18px;">library(ggplot2)
pathway = read.table("C://Users//Desktop//path.richFactor.head20.tsv",header=T,sep="\t")

画图

p = ggplot(pathway,aes(richFactor,Pathway))
p=p + geom_point()

改变点的大小

p=p + geom_point(aes(size=R0vsR3))

四维数据的展示

pbubble = p + geom_point(aes(size=R0vsR3,color=-1*log10(Qvalue)))

自定义渐变颜色

pbubble =pbubble+ scale_colour_gradient(low="green",high="red")

绘制pathway富集散点图

pr = pbubble + scale_colour_gradient(low="green",high="red") +
labs(color=expression(-log10),size="Gene number",
x="Rich factor",y="Pathway name",title="Top20 of pathway enrichment")

改变图片的样式（主题）

pr=pr + theme_bw()
pr</span>
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KEGGpathway.png