R语言 Bioconductor包的安装指南2019-05-20

R语言 Bioconductor包的安装方法变更V3.9
Bioconductor提供了基因组大数据分析的工具，是开源的持续更新的项目。每年会有2次更新。
由于Bioconductor 包的更新与R并不同步，因此，请务必使用Bioconductor 的更新方式进行更新，以免程序出错。

曾经： Bioconductor包的安装方法是这样：

source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)
biocLite(“EBImage”)

自上个版本后，Bioconductor 改进了安装方式，使用BiocManager包进行安装。

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(“EBImage”)

再也不用记Bioconductor 的网址了。。。

每次更新R版本后，记得运行

BiocManager::install()
Bioconductor version 3.9 (BiocManager 1.30.4), R 3.6.0 Patched
(2019-05-02 r76454)
Update old packages: 'BBmisc', 'genefilter', 'GenomicAlignments',
  'GenomicRanges', 'IRanges', 'MASS', 'reshape2', 'Rgraphviz',
  'RJSONIO', 'rtracklayer'
Update all/some/none? [a/s/n]:

检测Bioconductor 包的更新。

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