火山图又双叒叕来了,之前做的火山图已经很精美了。
3、跟着Cell学单细胞转录组分析(八):单细胞转录组差异基因分析及多组结果可视化
4、ggplot做火山图---添加任意基因标签|||突出显示标记基因
但是最近在做单细胞差异基因可视化火山图的时候,发现了一个问题,有些基因显著性也就是P值超级低,那么LOG之后数值甚至达到500以上,但是这毕竟是少数,大多数基因还是正常范围,作图的时候就会出现点溢出的情况,如果更改坐标轴范围,图很难看,上边顶天了,下面堆成一堆。
所以,这时候最好的呈现方式就是采用倾斜火山图,这样就不会出现上述问题。之前的文章讲过的倾斜45°火山图可以制作,但是最近感觉不太完美。
故而,在此推出ggplot做的对角线火山图,也是可以标签任意想要展示的基因,上下调基因。效果如下图:
我们此处以单细胞数据为例,转录组或者其他数据作图也是适用的。
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