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本次推文是GBD系列的第6篇,我们可以看示例文章中的Fig S1
通过聚类的方法将各个国家的发病率分为4组,我们可以看下文章里的方法描述部分:
可以看出这个方法是采用层次聚类分析的方法对发病率的EAPC进行聚类分组,查了相关的R包后,发现factoextra这个R包可以做层次聚类分析,并能做出相应的图形来。我们可以在图S1的基础上增加内容,我们比如可以根据结合发病率和死亡率的EAPC数据进行聚类
首先我们设定工作路径,读取相关的R包,读取原始数据
接着,我们获取发病率的EAPC数值
同样的,我们再计算出死亡率的EAPC数值
最后我们将两个数据集合并
随后我们进行聚类并作图
得到的图形输出如下
大家在AI里调整图形大小,让文字不重叠,根据各组的数据添加相应的图注即可。
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