Linux如何安装软件？
1.服务器下载conda-精华版--miniconda
2.安装和配置miniconda
3.使用miniconda：查看已安装的软件、搜索、安装、卸载（生信需要的）软件
4.定制conda的分身
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preparation
安装bzip2(因为免费阿里云没有)：输入 yum install -y bzip2
install Miniconda（an App store）
download [64-bit (bash installer)] for my computer
官网下载
复制下载链接
登陆服务器，进入wangyanhui1998目录 (可使用tab键自动补全目录名)
右键黏贴(选中，鼠标左键点一下是复制，右键点一下是粘贴)install
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
一路Enter，看到"please answer yes or no"输入yes
">>>"按回车
[no] >>> 输入yes
Thank you for installing miniconda3
- activate
source ~/.bashrc来激活conda
命令行输入conda，出现满屏的信息说明成功了
不成功就将miniconda这个目录删除，重新安装
不要删除安装包否则得浪费时间在下载上
参考演示视频 无声版
来自公众号：生信星球
密码：iwcd4k
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conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
USE
- 查看当前所有软件列表 conda list
- 搜索软件 conda search fastqc 【这里以数据质控软件fastqc为例】
- 安装软件 conda install fastqc -y 【加上-y是自动安装】
- 卸载软件 conda remove fastqc -y
总结
