小编前面也用了好几期的内容来给大家分享如何零代码做GO和KEGG富集分析,主要用到的是DAVID这个网页工具,并且零代码展示GO和KEGG富集分析的结果,主要用到的是Excel。
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换
2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析
3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果
4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG
6.零代码GO富集分析—一张图展示BP,MF,CC
可能有人会觉得Excel画出来的图不是那么好看,并且只能画柱形图。如果有一些R基础的话,我们可以绘制出一些更精美的富集分析图。前面小编也给大家介绍过
☞GO简介及GO富集结果解读
☞四种GO富集柱形图、气泡图解读
也给大家演示过如何使用R来绘制四种不同风格的富集分析图
☞GO富集分析四种风格展示结果—柱形图,气泡图
1.气泡图分三个框显示BP,MF和CC的富集分析结果
2. 柱形图分三个框显示BP,MF和CC的富集分析结果
3. 柱形图用三种不同颜色显示BP,MF和CC的富集分析结果
4. 气泡图+标签,显示BP,MF和CC的富集分析结果
我们可以使用相同的方法来绘制DAVID的GO富集分析图,同样可以得到上面四种风格的图。完整代码