从拿到第一份单细胞测序数据开始,恍然过了四年多;距汤神发表第一篇单细胞文章已经过去近十五年了。这些年里,单细胞领域发生的变化已经太多太多。最直观的变化:19年底我做的单细胞转录组项目还得3w/样本,而现在价格已经腰斩了一轮又一轮。现在入行的同学无疑是不幸且幸运的:不幸的是时过境迁,单细胞已经不再像多年前那样随便测两个样、分个群就能发好文章,层出不穷的单细胞文章倒逼大家卷样本数、卷分析方法、卷可视化方式;幸运的是随着单细胞成本的下降、单细胞分析社区的日益成熟,单细胞入行的各方面门槛也随之下降。
在我刚开始拿到单细胞数据时,面对天书一样的原始数据和deadline,心里充满了焦虑。那时的我每天疯狂地在互联网上检索,翻遍了GitHub和各类知识分享平台,花了两年的时间,我才发表了第一篇单细胞测序的论文。相信有很多和我一样"白手起家"的同学,能够与我共情,体会到训练单细胞分析技能的不易。为了帮助到像"曾经的我"那样遇到困难的同学们,我一手制作了二十万+播放量的单细胞教程,相信超过半数的粉丝是因为这个系列视频而与我们结缘。虽然我们一直在用心做好每一个教程,但是每个同学的需求不同、编程基础不同,并不是每一个同学都希望通过代码的形式来处理数据,也不是每一个同学都能够拥有足够支持完成硕博生涯的生信环境。
从上图可以看出,无论是以"single cell"还是"scRNA",PubMed中的相关文章每年都在以指数的形式上升。在"全民"单细胞的今天,仍有许多同学因为代码门槛而对这个行业望而却步。为了让更多的人无痛地加入单细胞/生信领域,我们做过很多的尝试。现如今,我们找到了志同道合的伙伴,共同开发并优化了SeekSoul Online单细胞分析云平台,以帮助大家以零基础、零代码的姿态从事单细胞相关数据分析与挖掘。在此,我们真挚地邀请您与我们一同体验、并优化SeekSoul Online(阅读原文可跳转):