项目管理办公室第三项职能是卓越职能，需要根据组织经验，参照业界最佳实践，结合组织的战略，优化流程，提升组织能力。
卓越职能承担着五大职责：
1、建立组织项目管理体系：既要考虑项目间的共性，也要考虑项目自身的特性。结合项目所处的环境和本身的特征来建立。主要包括基于生命周期的项目管理流程，与之配套的模板、工具和方法，以及相关的项目管理制度等。
2、建立和管理组织项目数据库：组织项目数据库囊括了组织在项目管理实践活动中积累的所有知识资产，如各类项目资料、以及实施过程中产生的与项目交付物有关的度量值，这些资产是持续提升组织项目管理整体水平的基础。
3、项目经理和项目团队成员绩效评价：基本用途，对于组织而言，通过分析绩效，可以发现薄弱区域，从组织层面采取统一的整改措施；对于个人而言，肯定成绩，发现差距，帮助提升和发展。扩展用途，委派项目经理的参考因素、选择PMO转家委员的依据、年度考核、晋级的依据。
4、建立项目管理能力框架：根据组织发展战略建立适合的项目管理能力框架，为组织选择、培养和储备项目管理方面的人才、制订相应的培训计划奠定基础。员工也可以参考制定自己的职业发展道路。
5、项目管理文化建立：项目管理文化的建立是很难的，但也是非常重要的。它的建设原则是从上到下，体现了组织对项目、项目管理、项目经理及项目结果的重视程度，使各职能部门根据项目的需要培养人才，配合项目经理工作，更好的协同相关部门，共同推进项目交付，促进组织持续发展。
