1.R语言运行
交互模式
常规的session，用source("z.R")运行脚本
批处理模式
在linux命令行运行 R CMD BSATCH z.R
（计算，小函数，赋值，内置数据集作图）
2.函数
oddcount()计算整数向量中奇数的个数
oddcount <- function(x) {
k <- 0 # assign 0 to k
for (n in x) {
if (n %% 2 == 1) k <- k+1 # %% is the modulo operator
}
return(k)
}
(1)小知识点
取整 %/%，取余 %%，
行首的大于号和加号，
for循环和k=k+1，
注意代码简洁，可以不写下标
函数中的return：没有显式调用return()时，R语言的函数会返回最后计算的值，不写需谨慎）
函数的作用域
{}内是函数体，里面的n、x都是局部变量，在函数体外无效
（2）关于参数
定义函数：g <-function（x,y=2,z=T）
调用函数：g(12,z=FALSE)
形参和实参：12是x的实际参数，接受了默认参数y，覆盖了参数z。
默认参数：y的初始化值是2。
3.数据结构
（1）向量
向量必须术语某种“模式”，即数据类型mode()，比如整数型、字符型
字符串实际上是字符模式(而不是数值模式)的单元素向量。
字符串的拆分和组合：paste和strsplit
u<-paste("abc","de","f")
u
v<-strsplit(u," ")
v
（2）矩阵
例：m<-rbind(c(1,4),c(2,2))
矩阵乘法：m %*% c(1,1)
取子集，提取子矩阵
（3）列表
值的容器，其中的值可以属于不同的数据类型。
x<-list(u=2,v="abc")
x
组件（组成部分），以$开头。
作图是有返回值的，返回列表
hn <- hist(Nile)
hn
print(hn)
str(hn)
str代表structure(结构)。这个函数可以显示任何R对象的内部结构，不只限于列表。
（4）数据框
通常通过读取文件和数据框来创建。是特殊的列表，可以通过$调用列。
（5）类
R语言是一门面向对象的编程语言。对象是类的实例。
4.扩展
读取--read.table，默认header=FALSE
class-查看类型，head，查看前几行。
lm(y~x)函数，拟合预测方程：y=β0+β1×x
lma <-lm(y~x)，lma是lm类的一个实例。可以调用attributes()函数列出它的所有组件。
5.获取帮助
（1）help()
help(seq)
快捷方式
？seq
?"for"
(2)example()
运行示例代码
example(persp)
(3)不清楚要找什么
help.search
(4)其他主题的帮助
整个包的帮助文档：
help(package=MASS)
主题搜索
?files
（5）批处理模式帮助
R CMD command --help
R CMD INSTALL --help
（6）互联网资源
R语言主页(http://www.r-project.org/)
R语言主页(http://www.r-project.org/)
CRAN(R语言综合资料网，网址为http://cran.r-project.org/)
微信公众号生信星球同步更新我的文章，欢迎大家扫码关注！
我们有为生信初学者准备的学习小组,点击查看◀️
想要参加我的线上线下课程，也可加好友咨询🔼
如果需要提问，请先看生信星球答疑公告
