一、与linux的再次相识
首先是下载我们生信需要用到的miniconda,说是要安装最新版本(latest),我当时以为是找时间最新的,没想到是带latest字样的,当时一顿操作,弄错了,重新再来
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ #这个就好
后来在安装时又出了毛病,真是一波三折
第一次安装
第一次安装,让我已经产生恐惧,已经有了miniconda3这个目录了,记得一定要在上层目录下删除这个。
安装成功标标志,把我高兴坏了、
实在不会安装:链接:https://share.weiyun.com/5J82l9g 密码:iwcd4k(花花老师贴上热心视频,虽然只有短短的几十秒,但是花花老师已经把她对小白的关怀放在这里了,写到此处,哽咽三次)
2.添加镜像(用清华的,速度更快,如果出国了,就用国外的就行了)
# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
3.使用conda,用conda list就行,要使用它就先安装它(conda install fastqc -y),和R语言一样,新版本不一定好用,有的需要老版本,用这个(conda install fastqc=0.11.7 -y),卸载把install改为remove就可以了。