水芹全草民间也作药用，其味甘辛、性凉，人肺、胃经，有清热解毒、润肺利湿的功效，对发热感冒、呕吐腹泻、尿路感染、崩漏、水肿、高血压等有辅助疗效。
1、内服水芹挥发油有兴奋中枢神经，升高血压，促进呼吸，提高心肌兴奋性，加强血循环的作用。内服水芹挥发油有兴奋中枢神经，升高血压，促进呼吸，提高心肌兴奋性，加强血循环的作用。
2、水芹的挥发油作局部外搽，有扩张血管、促进循环、提高渗透性的作用；内服能促进胃液分泌，增进食欲，并有祛痰作用。水芹的挥发油作局部外搽，有扩张血管、促进循环、提高渗透性的作用；内服能促进胃液分泌，增进食欲，并有祛痰作用。
3、水芹素及水芹素-7-甲醚有降压作用。水芹素及水芹素-7-甲醚有降压作用。
4、水芹水煎剂能使离体蛙心心率减慢，心肌收缩力降低，心输出量减少。水芹水煎剂能使离体蛙心心率减慢，心肌收缩力降低，心输出量减少。能对抗氯化钡和乌头碱所致的大鼠心律失常，对抗肾上腺素对心脏的兴奋作用。能对抗氯化钡和乌头碱所致的大鼠心律失常，对抗肾上腺素对心脏的兴奋作用。
5、水芹提取物对四氯化碳中毒鼠的肝脏有一定的保护作用。水芹提取物对四氯化碳中毒鼠的肝脏有一定的保护作用。
6、水芹煎液对α-荼异硫氰酸酯形成的大鼠肝炎有明显的退黄作用，血清胆红素含量明显下降，能使肝细胞和胆管上皮变性坏死病理改变明显减轻。水芹煎液对α-荼异硫氰酸酯形成的大鼠肝炎有明显的退黄作用，血清胆红素含量明显下降，能使肝细胞和胆管上皮变性坏死病理改变明显减轻。水芹注射液对四氯化碳性肝炎大鼠也有明显的退黄作用，并有明显的降酶作用。
现代药理研究表明野芹菜具有降血压、降血脂的作用。由于它们的根、茎、叶和籽都可以当药用，故有“厨房里的药物”、“药芹”之称。由于芹菜的钙磷含量较高，所以它有一定镇静和保护血管的作用，又可增强骨骼，预防小儿软骨病。野芹菜营养丰富，每100克食用部分（含茎、叶）含蛋白质1.9毫克、粗纤维1.7克、钙60毫克、磷51毫克、铁0.9毫克，还含有挥发性特殊物质。并在人体保健中独具功效，有健胃、利尿、净血、调经、降压、镇静等作用。可以增进食欲，健胃，解毒，用于料理河豚。尤为对于消渴的患者特别有益。空心类蔬菜大多都有清肠利尿的作用。
