儒学独尊的地位在晋朝被破处后到了南北朝时期已经形成多元化的思想。在诸多的思想流派中，出现了以法治国，务实求治的主张，（三国曹操与诸葛亮，东晋王导）和《无君论》、《神灭论》，提倡“人死则神灭“等有价值的观点，也产生了消极颓废，循世游仙的思想。
神学变迁：儒学在晋朝被破除后，到南北朝形成了多元化思想。
列：依法治国，《无君论》，《神灭论》
神灭论：神既形也，形既神也。
形体和精神是不分离的整体，没有形体，精神也没有。
以罗马书1:20节为例：神的永能和神性是明明可知的，虽是眼不能见，但藉所造之物就可以晓得。
无论从地面上还是水面上，或许这世界上的任何一方面都可以见证神的存在，但他们最终还是主张无神论。
根据威斯敏斯特小要理问答37：
人不是死掉就没了，而是要被审判。信者上天堂，不信者入地狱。因为人是有灵魂的，且灵魂不死。
影响最大的是玄学思想，文学在南朝十分兴盛。宋文帝时，设置玄学馆。玄学与史、文、儒并列四学，清谈益盛。到梁武帝时鼓励提倡经学。但此时经学已经受清谈影响。只重于辩论之说。隋朝统一后清谈渐渐衰退，直到唐朝中期才终止。由于佛教过度膨胀，出现了不少反对过度崇佛的思想家。如南朝梁范缜，北朝邢邵与北齐樊逊。这些人的思想生出无神论。
神学变迁：主要是玄学思想。
玄学：玄之又玄，众妙之门。
又称：新道家，形而上学
罗1:21因为他们虽然知道神却不当作神荣耀他……
他们虽然研究这世上的学问，但却没有发现神的创造。
神是创造天地的神，一切都是神的作为。因此这一切都关乎神。
范镇是南朝梁齐之间人士489年在竟陵王萧子良的宴席上，发表了反对佛教因果报应论。认为灵魂并不存在，他的观点主要是唯物论的变化的形一元论。认为身体与精神都是物质，整个宇宙就是一个物质的动态变化。神灭论处理了“体” “用” “变化” “关系”诸主题，完整概括了唯物本体论，所应处理之主要范畴。范缜著有《神灭论》与答复反对派曹思文的答曹舍人。他的观点引起朝野反弹，曹思文作难神灭论，萧探引“杜伯兰弓”，“伯有被介”故事驳之。笃信佛教的梁武帝也展开论战，作《敕答臣下神灭论》，命令他放弃观点。梁武帝组织僧俗60多人发表文章，对范缜进行围攻，引发思想界一场关于神灭不灭之理论大战。然而变化的行一元论的含意与变化广大，几乎可做无穷尽的推论引申，范缜辩才无碍，众人难以反驳他，最后判范镇为异端而流放他。
神学变迁：范镇在489年竟陵王萧子良的宴席上发表无神论演说，并且反佛教，梁武帝组织僧俗60多人对其围攻。但最后难以反驳。范缜被判为异端而流放。
在上帝的观点之下，这两个都是错的。根本不存在因果报应论，因为万有都是本于他，依靠他，归于他。愿荣耀归给他，直到永远，阿门。
也不存在神灭论，因为神是真实存在的。
北朝的邢邵与樊逊等思想家主张无神论。邢邵是北魏后期东魏初期人士。当时佛教受到鲜卑皇室提倡而兴盛。他反对神不灭论。主张人死则灵魂就会消失，否定人死为鬼的理论，认为“欲使土化为人，木生眼皮，造化神明，不应如此。”他还主张类话论只有同类事物才可已转化，不同类食物不能转化。类化说显现出物种产生的多元性与差异性。邢邵只想以及他和杜弼争论轮回等问题都记录在《北史，卷五十五，杜弼传》中。樊逊北齐人，544年北齐文宣帝御封禅泰山，樊逊向齐帝劝说道教神仙皆为虚妄。
神学变迁：邢邵主张无神论，认为欲使土化为人，木生眼皮造化生命不应如此。还主张类化论只有同类事物才可以转化。
类化论是错误的，因为彼前2:9讲到：“唯有你们是被拣选的族类……”只有人才会被拣选。
