心灵捕手是关于一个数学天才在心理学老师的帮助下治愈童年创伤的故事。威尔是一个自甘堕落的天才，他经常打架斗殴，进看守所是家常便饭，但是他却能解出黑板上教授花了两年时间解出的难题，兰博教授发现了他的天赋，找到了正在看守所的他，将他保释了出去，条件是必须每周做一次心理辅导，为了不再次回到监狱，威尔答应了。
心理咨询的主要对象是那些精神正常，但心理健康水平较低，产生心理障碍导致无法正常学习、工作、生活并请求帮助的人群，而不是病态人群。 心理咨询的主要对象可分为三大类：一是精神正常，但遇到了与心理有关的现实问题并请求帮助的人群；二是精神正常，但心理健康出现问题并请求帮助的人群；三是特殊对象，即临床治愈的精神疾病患者。其中，心理咨询最一般、最主要的对象，是健康人群，或者是存在心理问题的亚健康人群，而不是人们常误会的“病态人群”，病态人群例如精神分裂症、躁狂等患者是精神科医生的工作对象。
心理咨询师与来访者建立良好的咨询关系是非常重要的，对确立咨询关系起关键作用的因素是第一印象。心理咨询师的首要任务应该是与来访者之间建立起信任。威尔的第一次和第二次的咨询经历都不太成功，原因就是他的咨询师都把重点放在了治疗上，他们太过注重实际应用，而忽略了以他的情况到底适不适用，他内心真正的需求是什么，害怕的是什么，并且最重要的是威尔不愿意配合，所以前几次的咨询毫无悬念的失败了。于是兰博教授找到了他多年的好友肖恩教授。肖恩教授和其他的心理咨询师不一样，并没有一开始就问专业问题，而是先和他聊天，聊书、聊画、聊锻炼，直到后来聊到肖恩去世的妻子，他们大吵一架，不欢而散。兰博认为这一次也失败了，但肖恩却告诉他，让他下一次按时与他见面。
肖恩并没有像其他咨询师一样因为他说的话就放弃他，他选择了包容和理解，因为他知道这不是他的错。他虽然读过很多书，但是他从来都没有离开过波士顿，他并不是不想去，从肖恩说的话可以看出，他其实是不敢去，他不敢离开自己的熟悉的环境。肖恩对他说：“你不知道真正的失去，因为只有爱别人胜过爱自己才能体会，你应该从来不敢那样爱人吧。”这句话应该触动到了威尔的内心，他不再像以前一样抗拒。后一次的咨询双方一句话都没有说，因为威尔想要证明自己如果不想讲话就不用讲话，而肖恩也没有催他或者是先开口说话。这个小细节其实非常让我感动，这一段给我的感觉就是肖恩在陪一个任性的小孩玩谁先开口就输的游戏，而威尔的内心又何尝不是一个小孩呢，他从小就没有体会过真正的亲情，没有人宠过他，肖恩的做法也许让他感到了一点被宠的感觉，当然这只是我自己的理解。总之，威尔终于开始对肖恩敞开心扉，威尔告诉他，他不想再与心仪的女孩约会，因为他害怕自己发现她的不足，她就不再完美了，威尔其实是典型的回避型依恋人格，渴望爱情，却又害怕亲密关系，不轻易让人进入自己的内心。 肖恩告诉他，不完美的小特质才是最美好的，能选择让谁进入我们的世界，没有人是完美的，问题是你们是否完美的契合对方，这既是亲密关系的本质。
他选择了和心仪的女孩在一起，正当他们的感情逐渐升温的时候，女友想让他和她一起离开这个地方，他表现的非常抗拒，他并不想离开这个他生活了二十多年的地方，他害怕自己付出了真心却得不到回报。他没有可以倾诉真心的人，肖恩问他有没有心灵伴侣，他能说出来的只有莎士比亚、尼采、康德这些已经去世的伟人，他不能与他们面对面交谈，他们也不能对他作出回应。
影片的最后，肖恩再一次来到咨询室，肖恩一次一次的对他说，这不是你的错，他的心理防线终于彻底崩溃，他抱着肖恩像个孩子一样的大哭，这意味着威尔终于第一次与人建立了良好的相互信任的关系 。
本片没有专门展现威尔儿时被抛弃、被虐待的经历，而是通过威尔长大后与人相处的表现，向我们展现了一个缺乏安全感，而又渴望亲密关系的，内心敏感丰富的人。
