第二年，慕容儁去世前召慕容恪和阳骛以及司徒慕容评、领军将军慕舆根等人接受遗诏辅佐朝政。
事实证明慕容儁的决定是正确的。当时
可足浑后为皇太后。任命太原王慕容恪为太宰，总揽朝政；任命上庸王慕容评为太傅，阳骛为太保，慕舆根为太师，参与辅佐朝政。
这些核心成员里慕舆根是个不安定的分子。他性格质朴倔强，自恃是先朝的有功旧臣，心里不服慕容恪，因此行为举止傲慢。
当时太后可足浑氏经常干预朝政，慕舆根想要作乱，就对慕容恪进言说：“如今主上年幼，母后干预政事，殿下应该防范意外的变故，考虑用来自我保全的方法。况且平定天下，是殿下的功劳。兄亡弟及是古今的既成之规，等到先帝的陵墓峻工后，就应该将主上黜废为王，殿下自己登上尊位，从而为大燕带来无穷之福。”
慕容恪一所，正色说：“你喝醉了吗？怎么说这样的悖逆之言！我和你接受先帝的遗诏，你为什么突然提出这样的建议？”慕舆根面有愧色地谢罪退下去了。
慕容恪把此事告诉了吴王慕容垂，慕容垂劝慕容恪杀掉他。慕容恪说：“如今刚刚遭受先帝大丧，晋、秦两个邻国都在坐观灾祸，而我们辅政大臣如果自相残杀，恐怕有悖于远近民众的期望，暂且可以容忍他。”秘书监皇甫真向慕容恪进言说：“慕舆根本来就是庸人竖子，过去蒙受先帝厚重的恩宠，被引用参与辅佐朝政。然而小人没有见识，自从先帝驾崩以来，骄横日益严重，最终将要制造祸乱。您今天处于周公的地位，应当为国家深谋远，及早将他处置。”对这些话慕容恪心里明白但最终还是没有听从。
后来，慕舆根又向可足浑氏及前燕国主慕容暐进谗言：“太宰慕容恪、太傅慕容评将要图谋不轨，我请求率领宫中卫兵去消灭他们。”可足浑氏正要同意他的请求，慕容暐却说：“太宰、太傅二公是国家亲近而又贤明的人，先帝选择了他们，将我们孤儿寡母相托，他们一定不会干那样的事情。怎么知道不是太师你想作乱呢！”于是就没有同意慕舆根的请求。
慕舆根又思念东土龙城，向可足浑氏及慕容暐进言就：“如今天下衰败凋零，外敌不止一家，国家越大，忧患越深，不如东返龙城。”慕容恪听说这动摇国本的奸计，觉得再也不能容忍了。就与太傅慕容评商量，秘密地奏上慕舆根的罪行，让右卫将军傅颜在宫内杀掉了慕舆根，同时连他的妻子、儿子、同党也一并杀掉，并实行大赦。
这时前燕刚刚遭受了大丧，又诛杀了一大批人，宫廷内外都感到震动恐惧。太宰慕容恪则举止如常，人们看不到他有忧虑的神色，每当出入宫廷时也只有一个人随从。有人劝他应该自己严加防备，慕容恪却说：“当前人心正值恐惧，应当泰然自若以使他们镇定，为什么还要自我惊扰，那样民众将仰仗什么！”众人见状心里也就踏实了，从此人心逐渐稳定了下来。
慕容恪虽然总揽大权，然而对于朝廷的礼法仍是小心谨慎地严加遵守，每件事情都要和司徒慕容评商议，从来不独断专行。他还虚心对待读书人，向他们征求治国良策，根据才能授以官职，使人们各居其位。官属、朝臣如果出现过失也不公开宣布，只是根据情况加以调动，并且不让他们失去原来的等级次第，仅以此表示贬责。当时的人都以受到这样的处置为大愧，没有人敢轻易触犯。有人出现小过失，也都自己互相责备说：“你又想让宰公慕容恪调动你的官职啦！”
东晋朝廷开始听说前燕国主慕容儁去世，都认为中原可以收复。桓温却说：“慕容恪尚在，忧患正大着呢！”
