RNA酶是导致RNA降解的主要物质，广泛存在且稳定，可耐受多种处理（如煮沸、高压灭菌等）而不被灭活。RNA酶催化的反应一般不需要辅助因子，因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解，进而直接影响RNA分析结果。在所有RNA实验中，核糖核酸酶（RNA酶）的污染是导致实验失败的主要原因。因此，在RNA的制备与分析操作实验中，要严格防止RNA酶的污染。在RNA提取实验前对器材及试剂的处理非常的关键。焦碳酸二乙酯（DEPC）是一种强烈的RNA酶抑制剂，其通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使RNA酶变性，从而抑制RNA酶的活性。
（1）溶液处理 RNA制备过程中使用的所有溶液（包括水及其它盐溶液），需用0.1% DEPC，在37℃处理12 h以上；然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂，应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制，然后经0.22 μm滤膜过滤除菌。处理后的溶液要单独存放。
（2）塑料器皿的处理 所有的塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗。离心管和枪头等塑料器皿经0.1% DEPC，在37℃处理12 h以上，高压灭菌（尽量使用一次性无菌塑料制品；已标明RNase-free的塑料制品，如没有开封使用过，通常不必再处理）。
（3）玻璃器皿的处理 所有的玻璃器皿均应在使用前于200℃以上高温下烘烤至少6 h。
（4）有机玻璃的电泳槽等处理 先用去污剂洗涤、双蒸水冲洗、乙醇干燥，再浸泡在3% H2O2中，室温下泡10 min，然后用0.1% DEPC水冲洗，晾干。
确保RNA实验中使用的试剂及器材都经过RNA酶灭活处理，后续的RNA提取才能做好。
