学习笔记三

MultiQC的安装及使用

一， MultiQC的安装

输入代码： conda install -c bioconda -c conda-forge multiqc，输入y

安装成功

二， MultiQC的使用

1，下载SRA文件

输入 prefetch SRR17009175

prefetch SRR21519767

二，解压SRA文件

进入SRR17009175文件夹，输入，fastq-dump --split-files SRR17009175.sra

三，用FastQC进行数据质量测评

输入，fastqc SRR17009175_1.fastq.gz

在浏览器内打开html文件

四，得出结果

均在绿色区间，测序质量好

均在36之后区间，质量好

接头含量较高，可能由于序列短

结论：总体来说质量较好

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