双端组装时reads1 file与reads2 file不完全match

在用metaspade组装双端fastq，或用megahit组装双端fasta时，因双端不齐会报告相应的error。

这里保存biostars的经验方案：https://www.biostars.org/p/142407/

1 使用mothur list.seqs remove.seqs功能
2 使用BBMap repair.sh功能

解决思路：
1 使用软件删除非双端的序列
2 删除质量值与碱基数长度不匹配的序列
3 合并文件，采用单端组装方法

最后编辑于：2021.03.20 17:23:26

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