- 生信课上，老师介绍了PyMOL软件，下面是记录学习到的工具用法。
- 前期准备
在PDB上下载目的蛋白质三维结构的PDF文件。 - pymol上的具体操作
（1）点击菜单栏的File——>open，导入下载的PDF文件
（2）展示蛋白不同形态：lines，sticks，spheres，surface，mesh，dots，ribbon，cartoon。
操作：点击操作框中的S，在出现的框中选择需要的presentation
（3）各种小命令
hide：隐藏
color 颜色：修改颜色
zoom 氨基酸名称：可放大制定氨基酸其他对象会虚化
bg_color white：可设置背景颜色为白色
remove (selection)：从模型中删除选择的原子
show：可选择固定的原子以不同presentation展示
show reprentation [,object]
show reprentation [,(selection)]
show (selection)
