学习笔记4
1.登录Genome Announcements网站找一篇细菌基因组文章,记载SRA 号
2.从SRA 数据库下用prefetch下载该文件
3.Fastq-dump质控,去接头
4.Spades组装基因组草图
输出contigs.fa 拼接结果文件
5.Quast评价组装的基因效果
下载quast
quast 报告。
我这出问题了,一直搞不定,出现quast.py:command not found
1.登录Genome Announcements网站找一篇细菌基因组文章,记载SRA 号
2.从SRA 数据库下用prefetch下载该文件
3.Fastq-dump质控,去接头
4.Spades组装基因组草图
输出contigs.fa 拼接结果文件
5.Quast评价组装的基因效果
下载quast
quast 报告。
我这出问题了,一直搞不定,出现quast.py:command not found