2019-12-10

学习笔记4

1.登录Genome Announcements网站找一篇细菌基因组文章,记载SRA 号

2.从SRA 数据库下用prefetch下载该文件


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3.Fastq-dump质控,去接头


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4.Spades组装基因组草图


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输出contigs.fa 拼接结果文件


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5.Quast评价组装的基因效果
下载quast


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quast 报告。
我这出问题了,一直搞不定,出现quast.py:command not found

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