基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction...
写在前面 不少人应该知道,在生物模式,通路,调控机制上,PPT 已然是常规工具之一。类似的,那么画卡通热图,PPT一样靠谱。我们知道,Adobe Illustrator 和 ...
更多内容关注微信公众号:“今日之森” 后获取。 “好看的皮囊千篇一律,有趣的灵魂万里挑一” 进化树的构建绝不仅仅是将一堆序列扔进MEGA等建树软件,随便生成树那么简单,因为总...
IGV-Gene Structure Annotation Manual Editor,简称IGV-GSAme 写在前面 igv是目前最常用的本地基因组浏览器,与其开发的目标...
写在前面 昨天建立了TBtools使用交流群-5,很快就快200人。主要还是感谢大家帮手推广。刚才看到一个有趣的问题,正好,我手上在等一个流程的运行,那就大体写写。 TBto...
写在前面 很久很久以前,我就已经写过 GFF3/GTF 注释信息的部分提取功能。每一个GXF文件,往往包含的两万个左右基因(数万个转录本)的外显子,CDS等信息。而我们一般感...
问题 TBtools 提供了我自认为 全网最简便易用的 本地基因结构可视化工具。目前也有一定的用户。但是有时候会遇到这样的问题。 解决 事实上,很多参数都已经提供了。但是有部...
写在前面 半个月前,我推了一个《任何人都能掌握-基因家族分析》的腾讯课程(原本事实是开给课题组)。在热身课程(完全免费)中,将我个人对基因家族分析的认知和其意义均做了说明,感...
放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说,也是一时兴起写出来的。开发的...
写在前面 全基因组层面可视化特征标记(如基因位点),从文字标签到图形标签。文字标签应该是三四年前实现的。图形标签,Emmm,事实上,这个功能已经实现了太久,以至于我自己只记得...
写在前面 三年前,那时往“全国植物基因组会议”投个了摘要,也准备了下墙报,有点期待能得到点认可。当然和以前一样,优秀跟我没啥关系。这是结果,结果当然不会反过来影响过程。为了让...