很多基因家族个性化分析中，经常有基因motif+基因结构的看着还挺高大上的图片，小编接下来带你使用Tbtools做出这样的图片 准备作图文件 （1）根据gffread提取蛋白...
发简信
IP属地：山东
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Tbtools画tree+motif+基因结构+功能域 -
小江同学
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【生信】HMMER：hmmbuild自建hmm文件参考：https://www.omicsclass.com/question/705 首次用hmmsearch对我的蛋白质进行结构域搜索，最终只得到30个结构域。 拿这30个...
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基因家族分析(1) 基因家族成员的鉴定
最近有小伙伴问为怎么多快好省的发个论文顺利毕业，作为生物圈里的当事人当然推荐基因家族分析了，于是乎准备整理这一系列文档。在本文档中我主要侧重于后续的数据可视化，因为物种不同数...
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基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
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基因家族分析笔记 基因家族 同一个祖先基因经过变异，产生了结构、功能相似的各种表达蛋白，表达这些蛋白的基因统归为一个基因家族。 超基因家族 同一个祖先基因经过变异，产生了结构相似、功能不...
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基因家族专题(3)：基因家族成员的鉴定
Data preparation 继续上次的内容，下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下，下载好的数据。 基因组序列信息，存储基因组序列信息的.fasta文件。还有其...
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基因家族鉴定 hmmer+blast (含hmmer安装)策略 hmmsearch + blast 单独使用或者组合使用 hmmsearch可以做两次，第一次使用pfam中的多序列比对结果构建模型进行搜索，筛选过结构域后，使用本物种...
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TBtools基因家族分析详细教程（1）写在前面：非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具，作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义，课程购买地址，讲的很棒，可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
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TBtools的sequence toolkit常用功能介绍:
TBtools（v1.089）的sequence toolkit常用功能介绍: fasta extract (recommended) 给出序列的ID，可以提取特定序列，要点...
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<br>自学生信的小白，<br>生物届的一只单身狗!<br><br>从爬虫过来的蛇友！
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如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后...
