单线程生物
IP属地:贵州
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featureCounts(count计数), DESeq2(差异分析)...
博主 请教一下 可以不利用conda命令进行安装这些软件吗
mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的表达矩阵数据,但是无论是自身实验需要,还是从NCBI的GEO...
mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的表达矩阵数据,但是无论是自身实验需要,还是从NCBI的GEO...
声明:本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记,不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理,序列回帖到数据可视化...
tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要,去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...