在上一篇教程的最后,我写道「我们能够更加直观的观察到2个peak,基本确定2个多倍化事件」。这里就引出了一个问题,为什么我们可以根据peak来推断多倍化时间?在Lynch和C...
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在上一篇教程的最后,我写道「我们能够更加直观的观察到2个peak,基本确定2个多倍化事件」。这里就引出了一个问题,为什么我们可以根据peak来推断多倍化时间?在Lynch和C...
Ks可视化 我们在上一篇如何用WGDI进行共线性分析(一)[http://xuzhougeng.top/archives/comparative-genome-analysi...
多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多倍化,那么在基因组上就会存在一些共线性区域(即两个区域之间的...
My blog site:https://wordpress.com/home/yuntaobioinformatics.wordpress.com[https://word...
前言 点阵图(dotplot)作为比较基因组最基础的分析,常用的分析软件有JCVI、mummer等,这里介绍一种新的点阵图方法,即WGDI画点阵图。软件安装见小编另一篇博客W...
如果一个物种在进化过程中发生了多倍体化,那么,在基因组上就会存在一些共线性区域(即两个区域之间的基因是旁系同源基因,其基因的排布顺序基本一致)。多倍化以及后续的基因丢失和二倍...