Fastq格式是一种基于文本的存储生物序列和对应碱基（或氨基酸）质量的文件格式。最初由桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）开发出来，现...
IP属地：陕西
-
Fastq 格式说明 & (Phred33 or Phred64) -
NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
-
Sanger 测序，NGS 测序，数据分析
-
small RNA学习（四）：鉴定&注释产生小RNA的基因1. 使用ShortStack鉴定，注释产生小RNA的基因 1.1 下载安装 1.2 下载依赖的软件（包） perl, samtools, bowtie & bowtie-b...
-
如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点？
需求 客户的一个简单需求： 我有一批功能基因位点，想从重测序的群体材料中找到这些位点，如何批量快速获得？ 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实现 run.sh...
-
RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤，最终获得基因表达信息。...
-
R语言丨Linux系统中利用GAPIT进行GWAS分析
利用GAPIT进行GWAS分析的方法 引言 GAPIT是张志武老师开发的基于R语言的GWAS分析工具，能够根据表型和基因型数据自动进行不同模型的全基因组关联分析，网上有很多公...
