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作者，追风少年i hello，大家好，今天这个日子相信大家都不会陌生吧，不知道有没有当年复读的童鞋，日子很快，恐怕高考之后，再也没有经历过高中那种炼狱的日子。 今天我们分享一...

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在Seurat，我们选择使用future框架进行并行。如果您有兴趣了解更多有关future框架的内容，请点击此处[https://cran.r-project.org/web...

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pheatmap是绘制热图的经典R包。其中一些细节参数设置，之前每次遇到都是网上搜索。这次系统整理下常用用法，为以后绘图提供方便。 0、示例数据与R包加载 （1）模拟示例数据...

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GSVA基因集变异分析结合limma包分析差异基因集 基因集变异分析即GSVA（Gene set variation analysis）,是一种非参数的无监督分析方法，主要用...

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image Monocle2使用反向图嵌入（Reversed Graph Embedding）的机器学习算法，来对单细胞RNA-seq数据进行单细胞发育轨迹推断分析。Mono...

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差异基因表达分析是RNA-Seq实验中的常见任务，Monocle2可以帮助我们找到在不同组细胞之间差异表达的基因，并评估这些基因差异表达变化的统计学意义。 Basic Dif...

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image 在单细胞实验中，我们所取的组织样本通常是混杂有多种细胞类型的复杂混合物。解离的组织样本可能包含有两种，三种甚至许多不同的细胞类型。在这种情况下，最好使用已知的ma...

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Monocle包是一个强大的单细胞转录组数据分析工具，它引入了一个对单细胞进行排序的新方法（拟时序分析），通过利用不同细胞转录调控的异步过程，将它们沿着与生物过程（如细胞分化...

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ggstatsplot是ggplot2包的扩展，主要用于绘制可发表的图片同时标注统计学分析结果，其统计学分析结果包含统计分析的详细信息，该包对于经常需要做统计分析的科研工作者...

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拟时（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程，在发育相关研究中使用频...

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突然间发现，我一做热图就用pheatmap几乎不存在第二个选项了。是时候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一个值得注意的参数，它旨在说明你想...

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CellChat 三部曲2：使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析 加载所需的包[#load-the-required-libraries] 创建目录以保存图...

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CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程，然后R包作者也在B站做了直播介绍，cel...

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Load the required libraries Create a directory to save figures Load CellChat object of ...