原文链接： https://www.embopress.org/doi/10.15252/msb.20188746 主编评语 这篇文章最好的地方不只在于推荐了工具，提供了一套...
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重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）
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RNA-seq分析（STAR-RSEM-DESeq2）
一、准备RNA-seq数据 需要参考基因组文件，注释文件，样本的fastq.gz文件 检查fastq.gz是否完整 二、fastqc生成质量报告（multiqc 提高查看效率...
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生物信息学专业<br>公众号：生信学习手册
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RNA-seq 分析流程 —— 概述前言 接下来我们要介绍的是 RNA-seq 数据的处理分析流程，根据 RNA-seq 测序技术的不同，可以分为三种： short-read long-read direct ...
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从0开始，包括软件安装，环境设置，原始数据下载，转换，差异基因分析等整个流程
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SV工具包SURVIVOR的使用
SURVIVOR 是一套用于模拟/评估 SV、合并和比较样本内及样本间 SV 的工具集，其还可对SV进行重新格式化及进行统计总结，其他详细信息也可参考工具的wiki。 安装 ...
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全基因组 - 人类基因组变异分析（PacBio) （2）-- CCS的使用一、基因组 PacBio SMRTbell文库的构建流程 1. PacBio SMRTbell 文库的结构 PacBio测序平台构建完成的测序文库形状就如同一个哑铃(Dumb...
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picard——修改BAM文件的Read Group在使用GATK进行变异位点检测时，报错A USER ERROR has occurred: Argument emit-ref-confidence has a bad va...
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软件6 —— sambamba和picard
一、 基本介绍 (1) 关于PCR重复的问题 RNA-seq一般不去重复（起始量高，扩增数少；某些RNA表达量很高，导致该基因的reads的比对很可能出现一致的情况） Ch...
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CNVkit call CNV
最近在做CNV项目，整理一下用CNVkit call CNV的 pipeline 1.软件下载和安装 首先cnvkit是根据python写的，所以首先需要安装python。c...
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很多帖子被下架了。以后开直播带货吧。写不动技术贴了。
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生信小白一枚，<br><br>有问题可以私信我，<br><br>谢谢。
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命运把你带到那里，那你就大大方方的去
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群体遗传变异——拷贝数变异分析基因组发生重排而导致的,一般指长度1 kb 以上的基因组片段的拷贝数增加或者减少, 主要表现为亚显微水平的重复或者缺失。因此称为“微”缺失/重复变异。在基因组水平上，CNV ...
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优美胜于丑陋，明了胜于晦涩，简洁胜于复杂。<br>复杂胜于凌乱，扁平胜于嵌套，间隔胜于紧凑。
