IP属地：安徽
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vcf转phylip格式
这里使用的是 tassel软件里的程序
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基因有效位点构建单倍型移除缺失位点，基于有效位点构建单倍型，统计每个单倍型的位点数量 核心实现说明（位点个数列 site_count）：数据收集：1、用 haplot...
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单倍型整理前4列分别是chr pos REF ALT，第5到37列是样本，第40列是gene_id列，根据gene_id，识别不同的单倍型，结果中增...
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2025-07-11
读取 CSV 文件 file_path <- "merged_SV_data_27.csv" 构建输出文件名 output_file <- su...
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计算SV长度并统计均值sd
输出 例：SV的起止位置是1-2000，则长度为： 2000-1+1=2000
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分列统计均值sd
第一列是label2，有三种元素，分别是gene、intergentic、overlapped、promoter，第二、三、四列分别是Fre1、...
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字符替换
遍历文件，含有多个CDS的替换成CDS、如果有1个以上gene替换成gene、如果有1个以上promoter替换成promoter，把.替换成i...
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SV样本信息提取
提取样本信息 #######提取样本基因型 0/0、0/1、1/1基因型的意义: 在遗传学和基因测序领域，0/0、0/1、1/1 是常见的基因型...
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