绘图: blocks 主要流程:(忘了)
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获取当前文件夹下所有bin文件 绘图
参考文献: Reveal genomic insights into cotton domestication and improvement using gene leve...
粳稻渗入片段鉴定纯Python脚本 参考黄学辉老师,Rice_Heterosis/identification_of_indica_japonica_introgressio...
生成特征值文件plink.eigenvec,特征向量文件plink.eigenval 绘图
fasta文件拆分 多线程,保存到一个文件夹里,需指定 -o
参考文献: https://www.nature.com/articles/s41586-025-09686-5#MOESM1[https://www.nature.com/...
绘制圈 绘制基因 添加热图 添加散点图类型的环形 ------------------------------------------------------------- ...
将A序列着丝粒区域与其它品种比对,查看特异性,这里我试着使用 将A序列拆分成1kb的序列,再将序列比对到合并后的其它品种序列,流程如下: 首先将序列拆分成1kb的区段: 将其...
对于两条染色体片段序列的全局比对(强制比对全长,即使存在长度差异或局部不匹配),推荐使用基于Needleman-Wunsch 算法的工具,这类工具专门用于全局比对,能计算全长...
提取sv信息
cuteSV CRR279451_sorted.bam nip.fa IR64.vcf IR64/
提取出每条染色体着丝粒区域,比对到不同参考基因组,查看差异: 另具体信息: all