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测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...

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近几年来肿瘤免疫疗法已成为肿瘤治疗领域的焦点。美国免疫学家詹姆斯·艾利森 (James Allison) 和日本生物学家本庶佑 (TasukuHonjo) 凭借「发现负性免疫...

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本期制作人 肿瘤思维导图-胆管癌 Tumor Mindmap -Cholangiocarcinomas 胆管癌(Cholangiocarcinomas，CC)是较为少见的...

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①下载TXT文件和平台文件 若数据平台文件无gene symbol 和探针序列or GBlist，则无法注释。 ②ID转换 1.平台文件有gene symbol 平台文件改名...

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①TCGA数据 输入文件 ：获得human.gtf文件，用来注释基因属性 perl代码如下 ②GEO数据 perl代码同上

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1. clusterProfiler包，bitr()转换ID函数 clusterProfiler 是Y叔写的一个功能强大的R包，可以用来做各种富集分析，如GO、KEGG、DO...

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PMID: 发表杂志：Aging (Albany NY) 知识点 FRGs：Ferroptosis-related genes, 铁死亡相关基因，作者从FerrDb[http...

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不管是初入临床的小白医学生，还是罹患癌症的患者及其家属，抗癌药物的疗效都是他们最关心的事情。但查阅相关文献的时候，又常常会被如OS、PFS、DFS、DCR、ORR等搞得晕头转...

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之前有篇文章返修的时候审稿人就问了这样一个问题：为什么使用ROC曲线而不考虑PR曲线，有没有尝试过其它方法进行分类诊断？于是就有了今天总结的内容。 1.ROC诊断曲线 背景 ...

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在分类问题里，有几个重要的指标可以用来衡量算法的能力，比如Recall（召回率），Precision（精确率），F1值等。P-R曲线，ROC曲线，AUC曲线等。之前已经对前三...