转录因子(Transcription Factors, TFs)指能够以序列特异性方式结合DNA并且调节转录的蛋白质。转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色质和转录，以形...
发简信
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Cell重磅综述:关于人类转录因子,你想知道的都在这
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HZAU植科院农学本科毕业生<br>HZAU信息学院生信专业硕士毕业生<br>目前就职于国内某知名药企数据分析岗位<br>主要擅长SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>对爬虫、网站搭建感兴趣<br><br>欢迎一起讨论呀~<br>简书不定时查看，有需要欢迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
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single cell marker 基因数据库在单细胞转录组测序中一个重要的方面就是定义聚类得来的cluster，一个思考的方向就是根据marker基因来定义cluster的细胞类型（cell type）。怎样才能建立c...
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生信初学者--小瑜
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exon,intron,CDs,UTR学习题外话：Python中可通过Lib目录下的idlelib子目录下的idle.pyw或者idle.py进入Python的IDLE界面 DNA中的基因可以分为编码区和非编码区，编...
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生信坑底躺着不动的男人<br>简书不常在，有问题可私信
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@njmujjc 谢谢！应该就是这个问题😂
10xgenomics做scRNA-seq
PATH=/media/pc/disk2/jjc/2018-9-5-scRNA-seq/cellranger-2.2.0:$PATH ##fastq文件名字要改为SRR623...
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Seurat：Integrating stimulated vs. control PBMC datasets to learn cell-type specific responses说明：仅根据官网指南加个人理解，目前官网上发布了3.0版本的指南，下面内容是2.4版本，内容上有些许出入。 整合分析的目的： 1. 鉴定在两种数据集中都存在的细胞类型2. 得...
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单细胞转录组||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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你好，我下载的原始数据也是SRR6230316，请问你拆成fastq文件时怎么拆成10×genomics的标准格式啊？我用--split-files还是只有一个fastq文件。
10xgenomics做scRNA-seq
PATH=/media/pc/disk2/jjc/2018-9-5-scRNA-seq/cellranger-2.2.0:$PATH ##fastq文件名字要改为SRR623...
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@周运来就是我 我也是用的--split-files，但是拆出来只有一个fastq文件，是因为作者上传数据不全吗
10X单细胞测序分析软件:Cell ranger
单细胞测序有着漫长的过去，却只有短暂的历史---谁说的！ 说她漫长是因为到如今也有十几年的历史了，说她段短暂是因为针对单细胞的分析工具越来越有意义开发周期却越来越短。一般生物...
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请问从NCBI上下载的sra原始数据拆分成fastq文件怎么能适合进入cellranger呢？用fastq-dump拆分后只有一个文件夹（参数改过也没用），文献里显示是10×genomics的数据。
10X单细胞测序分析软件:Cell ranger
单细胞测序有着漫长的过去，却只有短暂的历史---谁说的！ 说她漫长是因为到如今也有十几年的历史了，说她段短暂是因为针对单细胞的分析工具越来越有意义开发周期却越来越短。一般生物...
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服务器上Rstudio的安装(Rstudio-server)
自己平常在用R/Rstudio本地处理数据或者画图时，因数据量太大（电脑性能太差）而经常卡的不行。前些天突然了解到原来在服务器上也可以装Rstudio，其与本地电脑图形化的界...
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你好，如果没有管理员权限应该怎么安装服务器版Rstudio呢？
安装服务器版的Rstudio
Rstudio-server：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/ 安装方法参考：https:/...
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小刘哥，农民、生信民工、程序员、理想主义者
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优美胜于丑陋，明了胜于晦涩，简洁胜于复杂。<br>复杂胜于凌乱，扁平胜于嵌套，间隔胜于紧凑。
