0.输入数据 在生信星球公众号聊天窗口回复exp777即可获取，里面的数据如下： 我的小R包，从写着玩到用起来，日渐丰满了。今天的更新，1.5以上的版本可用哦，去我的gith...
IP属地：上海
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箱线图、热图、火山图、PCA、韦恩图全部拥有 -
宝藏R包tinyarray：常用图表一键收走最近抽空整理了以前写的函数，规范tinyarray包，反复检查和优化，调整了好久，终于得到下面的check结果 今天把他提交到CRAN了(是提交不是接收哈，没有那么快)整理了...
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解决了，后来我用了R来整理@fc79c326f246
TCGA临床数据的提取
TCGA临床数据的下载这里不做介绍。下载后解压数据会得到包含多个子文件夹的的文件，如下所示： 每个子文件夹下通常包含XML文件，有的也会包含多个文件。但我们需要用到的就是XM...
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遗传学 博士研究生在读
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R语言画实现t-SNE分析和画图1.编一个数据 需要一个行为样本，列为变量(例如基因)的矩阵。 2.完成tsne分析并画图 画图搞起 3.神奇参数perplexity perplexity的默认值是30。样...
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使用limma、Glimma和edgeR对RNA-seq数据分析笔记1 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力正是Bioconductor的核心优势之一。在获得RNA-seq基因表达矩阵后，通常需要对数据进行预处理、探索性数据分析、差异表...
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超有诚意的R语言数据读取指南
2020-2-23 更新：import 输入其他格式的数据报错的问题，可用参数format 解决，例如format = "\t"。帮助文档中该参数解释为： An option...
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生存分析中连续型自变量截断值的确定方法题记：本文重点讲解在生存分析中如何合理设置连续型自变量的截断值，将连续型自变量转换为二分类变量。 1.背景知识 对于结果变量为二分类资料的数据，连续型自变量截断值的确定一般通...
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从TCGA数据中提取lncRNA(这是一个找bug教程)从果子老师的从TCGA数据中提取lncRNA并进行下游分析一文中，我学到了如何从TCGA表达谱数据中提取RNA。老师的教程已经写的很详细了，我再补充一点：如何下载GTF注视文...
