跑完了，记录一下，顺便写写我在使用中遇到的问题，欢迎讨论～声明：我是用自己数据跑的，因为还未发表所以就还是借用官网的图啦～ 1.准备 2.加载数...

数据集：cellDancer文件 PancreaticEndocrinogenesis_cellDancer_estimation.csv[ht...

1.安装 2.准备数据，跟scVelo处理数据步骤相同，详见：单细胞 | RNA速率 · scVelo - 简书 (jianshu.com)[h...

1.准备数据：从seurat对象中提取metadata（R中运行） 下面都在python中运行，根据一致的barcode，整合loom文件和me...

接上一篇，pySCENIC分析完之后就可以进行可视化[https://so.csdn.net/so/search?q=%E5%8F%AF%E8%...

SCENIC (Single-Cell rRegulatory Network Inference and Clustering）是一种能够从单...

研究背景：测序数据中存在未剪接mRNA 基于SMART-seq2、inDrop 和 10x Genomics Chromium的测序方案，发现 ...

cellDancer：一种基于模型的深度神经网络（DNN）框架 已知：mRNA的转录动力学由转录速率（α）、剪接速率（β）和降解速率（γ）决定，...

R包下载网站：https://cytotrace.stanford.edu/CytoTRACE_0.3.3.tar.gz[https://cyt...