经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。 差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等...
我们现在知道,当RNA被包裹在囊泡中或通过与脂蛋白或RNA结合蛋白结合时,它可以在生物液体的恶劣环境中生存下来。这些细胞外RNA(exRNA)在细胞间信号转导中发挥作用,作为...
本节概览1. WGCNA基本概念:定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行:⓪输入数据准备①判断数据质量,绘制样品的系统聚类树②挑选最佳阈值power③ 构...
矩阵与 矩阵列数相等的向量作整除 矩阵与 矩阵行数相等的向量作除法
一、什么是RPKM、 FPKM、TPM、CPM RPKM, FPKM and TPM, clearly explained - StatQuest!!![https://st...
#mRNA表达矩阵与GROUP文件样式,heatmap样式见文章最后 library(limma) mRNA <- read.table("表达矩阵.txt",sep = "...