发简信
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学习笔记目录开个帖子整理一下自己的生信学习笔记目录，方便日后查看：最近更新：2022.07.03 bulk RNA-seq: 实战系列: RNA-seq入门...
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2026版单细胞测序scRNA-seq入门实战（十一）：Monocle3，从Seurat无缝衔接细胞分化轨迹本节概览： Monocle3简介：了解拟时序分析的意义和Monocle3的核心原理与优势。 数据准备：从Seurat对象无缝转换为Monocle...
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2026版单细胞测序scRNA-seq入门实战（十）：NicheNet细胞通讯分析本节概览： NicheNet简介：了解NicheNet的核心理念及其与CellChat的互补关系。 小鼠专用数据库：加载小鼠配体-受体网络、配体...
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2026版单细胞测序scRNA-seq入门实战（八）：差异基因筛选与GO/KEGG富集可视化本节概览：分析目标：从已注释的Seurat对象中提取星形胶质细胞（Astrocytes）和OPC（少突胶质前体细胞），比较两者转录组差异。差异基...
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# 先导编辑（Prime Editing）技术详解——从分子机制到epegRNA设计策略先导编辑技术详解——从分子机制到epegRNA设计策略 本节概览 一、先导编辑概述：无需DSB与供体模板的精准编辑二、先导编辑的分子机制三、先导...
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2026版单细胞测序scRNA-seq入门实战（七）：CellChat细胞通讯分析——揭秘细胞间的“对话”本节概览：CellChat简介：了解细胞通讯分析的意义和CellChat的工作原理。数据准备：从Seurat对象提取表达矩阵和元数据，构建Cel...
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基因敲降实验的对照设置全解析——稳定与诱导型shRNA系统的方案与误区
基因敲降实验的对照设置全解析——稳定与诱导型shRNA系统的方案与误区 基因敲降实验的对照设置——稳定与诱导型shRNA系统的完整方案 本节概览...
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2026版单细胞测序scRNA-seq入门实战（五）：标准化降维聚类与Marker基因筛选（附细胞周期评分）本节概览：重新标准化：去除 doublet 后，基于新的细胞组成重新进行 LogNormalize 归一化。高变基因选取：用 vst 方法挑选 ...
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2026版单细胞测序scRNA-seq入门实战（四）：单细胞数据质控——过滤细胞与基因（含去除双细胞步骤）本节概览：核心质控指标：nFeature_RNA、nCount_RNA、percent.mt[https://percent.mt/] 的含义与...