通常来说，GEO和TCGA的基因表达数据和临床数据是分开的，为了合并这两个数据，这里使用R进行操作。 基因表达数据如下： 生存数据如下： 在R中读入上述两个数据，然后使用代码...
IP属地：北京
-
基因表达矩阵和生存时间的合并 -
TCGA的差异基因分析在分析TCGA数据库里的RNA-seq数据之前，先了解一下TCGA样本的id名称里的小秘密：参考文章：TCGA的样本id里藏着分组信息 根据文章里的内容，我查看了前一篇文章里...
-
MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
-
-
基于R对TCGA患者临床数据整理和Cox分析
一、数据整理 1 导入数据 利用data.table包导入数据，以LUAD为例 2 选择感兴趣的临床信息 一般常规项包括submitter_id，vital_status，t...
-
-
我得到一个空表，为啥呀
TCGA转录组数据及临床数据下载及整理
一、TCGA转录组数据下载及整理 ①进去先看cart是否为空，没有要清空。 ②下载转录组数据 基因表达量包括LncRNA和mRNA，用矫正后的FPKM下载3个文件 ③下载数据...
