细胞互作分析中中确定关键配受体 细胞互作中确定关键配受体几种方法 基于阈值的方法配体受体基因表达>指定阈值,在进行后续配受体CCI推断CellT...
文章简介 背景介绍 Result: Identifying nested, hierarchical structure with NeST(使...
文章简介 摘要 功能富集分析是生信分析基础的方法,对揭示感兴趣基因参与的生物进程至关重要,但是富集结果又长又冗余 很难总结 目前简化富集分析结果...
文章简介 背景简介 soupX可以是单细胞转录组数据分析中 质控中的步骤。基于液滴法的单细胞转录组测序,液滴有以下其中情况,理想情况的 是单个细...
今天上午听了作者讲解CARD,基于去卷积方法进行空间与单细胞联合分析的软件,可以做: 单细胞cluster与空间数据联合 没有单细胞ref的数据...
空间转录组学简介 原理 step1:新鲜冷冻组织切片成像冷冻组织不能直接用液氮,急速降温会导致细胞损伤,10X建议用OTC包埋的异戊烷速冻组织:...
方法1 umap降维图:亚群间距离越近,越相似 方法2 查看cluster间差异分析结果中marker基因,可从genecard中查看top的几...
细胞凋亡Apoptosis 触发的细胞凋亡通路内源性的线粒体途径(BCL-2途径)由BCL-2蛋白家族的促凋亡和抗凋亡成员调节外源性的死亡受体途...
下载步骤 使用TCGAbiolinks下载BRCA CNV数据,发现 data.type不全面,仅含有三种 Copy Number Segmen...