介绍：https://www.jianshu.com/p/63071b368be5[https://www.jianshu.com/p/63071b368be5]安装：注意：...
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用Seurat做RNA Velocity -
基于Seurat UAMP和celltype的RNA Velocity速率分析的全套流程参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官网Tutorial[https...
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Seurat-单细胞差异表达分析
加载数据 此插图强调了一些在Seurat中执行差异表达的示例工作流程。出于演示目的，我们将使用在第一个指导教程中创建的2700 PBMC对象。您可以在此处[https://w...
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scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程拟时（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程，在发育相关研究中使用频...
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单细胞分析实录(15): 基于monocle2的拟时序分析关于什么是“拟时序分析”，可以参考本期推送的另一篇推文。这一篇直接演示代码 monocle2这个软件用得太多了，很多文章都是monocle2的图。因为只使用表达矩阵作为输入，...
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Seurat基因集打分函数AddModuleScore与之前学过的AUCell一样，Seurat里面自带的函数AddModuleScore也可以给细胞打分，我用之前拿的数据，把AUCell换成AddModuleScore玩一下。...
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单细胞基因集打分实操之irGSEA
Immugent在推文一文带你了解单细胞数据基因集打分的所有算法[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1Nw==&mid=...
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10X单细胞（10X空间转录组）基因集打分方法汇总
hello，大家好，今天周一，做一个简单的汇总，主要针对基因集打分，无论是单细胞还是空间，基因集打分都很普遍，方法也很多，我们来总结一下。 研究背景 在单细胞转录组测序中，整...
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刘小泽学习组合多个单细胞转录组数据刘小泽写于19.10.8前几天单细胞天地推送了一篇整合scRNA数据的文章：使用seurat3的merge功能整合8个10X单细胞转录组样本这次根据推送，再结合自己的理解写一...
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【ChIP-seq 实战】七、可视化（IGV部分）这里是佳奥！ 获得了peaks之后我们导入IGV检查。 1 deeptools初探 bamCoverage的基本用法 得到的bw文件就可以送去IGV/Jbrowse进行可视化...
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bioinfo100-第6题-读懂FastQC报告 Part Izhn-blogmhw-zh 读懂FastQC报告 Part I 通过前面的5个问题，我相信大家对Illumina测序，测序的储存文件格式，一些简单的建库原理已经有了一个初步...
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码代码，码文字，从不偷工减料。<br>他有着一副人畜无害的皮囊，还有着一颗沁人心脾的有趣灵魂。<br>--------------------------------------<br>长篇小说：《青春在硬盘里灼烧》<a href="https://www.jianshu.com/nb/18333720" target="_blank">http://www.jianshu.com/nb/18333720</a><br>已完结.<br>第二部职场小说《程序猿生存指南》连载中，欢迎关注。<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fjuejin.cn%2Fpost%2F6844903705351815176" target="_blank">https://juejin.cn/post/6844903705351815176</a><br>--------------------------------------<br>公众号ID：huqitongzi<br>欢迎找我聊天，微信也在下方。
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2016年徒步太平洋山脊小径<br>2018年骑行318川藏线<br>2019年徒步阿帕拉契亚山径<br>2021年徒步大陆分水岭小径
