之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工,再多学一点新知识~这次的笔记是生信技...
笔记回顾:1.GEO数据库视频学习笔记(芯片数据下载和数据读取)2.GEO数据库视频学习笔记(ID转换)3.GEO数据库视频学习笔记(了解你的表达矩阵) 这一讲的视频地址是:...
本文首发于“生信大碗”公众号,转载请注明出处 今天要给大家分享一个实用的差异分析工具——GEO2R。不需要语言基础,直接点点点就可以完成。 GEO2R是GEO数据库中的一个在...
一、数据下载 官网——搜索并点击GSE、GLP相应文件下载 文件格式为: txt txt.gz(GSE文件) 二、对txt.gz文件进行解压缩 使用Rstudio 正常...
GEO2R(GEO to R)是GEO数据库自带的数据分析工具。GEO2R可以通过可视化的方式对基因表达谱进行统计学分析,在操作上非常方便,但是,某些数据集不提供GEO2R功...
老大让复现的是一张韦恩图,来自3个数据集,分别找每个数据集的差异基因,然后取UP和DOWN的交集。原文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/...
基因表达 什么是基因表达,如下是来自于维基百科的解释: 研究方法 定量PCR 这部分我不太懂,所以就放几段百度百科和维基百科的定义。 百度百科 定量PCR(即时聚合酶链锁反应...