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  • 您好,我想使用FLAIR对ONT数据进行差异可变剪接分析,我运行了FLAIR的全部步骤,但是flair diffSplice只定义了4中可变剪接事件,因此我想先使用FLAIR进行数据处理(到flair collapse这一步),然后使用suppa2进行差异可变剪接分析,不知道这样做是否合适?suppa2需要输入TPM,请问如何从flair collapse输出的结果中得到TPM,您有没有推荐的定量方法或推荐的差异可变剪接分析的软件?感谢~

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