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TCGA数据整合后进行DESeq2差异表达分析和基于R的多种可视化测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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你是如何查看电脑里有几个版本的R
Rstudio一片空白怎么办？
R软件差不多半年就能出款新的，有的包只能在更新的版本上使用，所以尝试了一下更新R。R不同版本相当于独立的软件，电脑上允许同时有多个版本的R。下载只要在默认路径下安装，Rstu...
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北京中医药大学博士，一个会科研的中医大夫
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Rstudio一片空白怎么办？R软件差不多半年就能出款新的，有的包只能在更新的版本上使用，所以尝试了一下更新R。R不同版本相当于独立的软件，电脑上允许同时有多个版本的R。下载只要在默认路径下安装，Rstu...
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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单细胞技术，分析方法
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质控，组装，预测，注释，比较，进化一条龙
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
