肿瘤不是单纯的恶性细胞群，而是由不同类型细胞组成的复杂生态系统。在这些细胞中，肿瘤浸润免疫细胞在肿瘤控制和治疗反应中起着核心作用。例如，细胞毒性...

2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Tr...

estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分，进而评估肿瘤的纯度，其原理通过特征的肿瘤的RNA-seq的signtu...

目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT...

介绍 DESeq2常用于识别差异基因，它主要使用了标准化因子标准化数据，再根据广义线性模型判别组间差异（组间残差是否显著判断）。在获取差异基因结...

0.输入数据 在生信星球公众号聊天窗口回复exp777即可获取，里面的数据如下： 我的小R包，从写着玩到用起来，日渐丰满了。今天的更新，1.5以...

前言 之前我们介绍了maSigpro的基本建模方式：分析时间序列的RNA-seq tool[https://www.jianshu.com/p/...

简介 这是复现一篇结肠癌的文献图例，GSE4107，文献地址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/...

Pathway Analysis讨论及基因富集分析软件（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）使用实战 在所有物是...