GSEA的介绍:https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相应的软件,其实clusterProfiler除了做go term 富集...
韦恩图,Venn diagram,常用图的一种,用来展示集合之间的特异性和共同性。现在有很多在线的网站都可以绘制,但是R来画也方便,其中ggvenn是基于ggplot2的专门...
AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集(如gene signature,gene module)的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...
AUCell 1.提取指定GOterm的基因 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7606976/[https://ww...
WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点,可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
这篇文章在2020年7月上传到了bioRxiv(Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...