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sc-Review:物种间单细胞转录组数据分析TY - JOURAU - Shafer, Maxwell E. R.M3 - 10.3389/fcell.2019.00175TI - Cross-Species ...
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R相关性分析和相关性热图相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...
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有了TPM，怎么做基因表达分析、相关性分析和主成分分析TPM是RNAseq测序结果里很好的归一化表达矩阵，以前都是FPKM，但目前TPM才是主流，很多测序公司也开始用TPM作为基因定量单位进行分析了，基因表达分布、相关性系数和主...
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[富集分析] 4、clusterprofile富集分析--多组设计的富集及可视化1、富集分析的背景知识 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
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六. 基因表达相关性分析与作图（R语言“corrplot”包）一. 简介 corrplot包是一个画相关系数图的包，可以用来对基因的表达数据进行分析，分析不同基因间表达的相关性。 二. 实例 1. 数据格式 2. R代码 3. 图片输出
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ggplot2画tSNE（UMAP）的聚类点图（带圈带阴影）今天我们学习一点简单的，实现下面这张图 绘图： 1. 首先加载数据，然后用查看一下数据长什么样子 2. 开始画图： 首先，可以看出这张图是张点图，而x轴、y轴和点的颜色分...
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关于win10下MX pro 5连接电脑不显示问题
今天连接MX pro5到电脑却在我的电脑上不显示，而之前一直没有问题，google一下，原来是自己开启了调试模式，win10下就会出现驱动安装错误，无法在我的电脑上找到MX ...
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单细胞转录组||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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使用scater包进行单细胞测序分析（一）：数据导入与SingleCellExperiment对象构建
scater包简介 scater是一个优秀的单细胞转录组数据分析工具包，它可以对单细胞数据进行常规的质量控制，数据的标准化与归一化，以及数据的降维与可视化分析。它主要基于Si...
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单细胞分析之细胞交互-3：CellChat常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
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测序深度和测序覆盖度，怎么估算？在我们开始测序之前，经常会被问道，你需要的测序深度和测序覆盖度的概念，比如在测序线粒体的DNA时候，测序小哥就问说1个G的数据量够了吗？下面就给大家解释下这两个概念： 测...
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2021-04-28corrmorrant包快速绘制相关图发现了一个可以快速绘制相关图的ggplot2扩展包(https://www.business-science.io/code-tools/2021/04/27/corrmor...
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Seurat绘图函数总结（更新版）更多重要函数见：Seurat重要命令汇总[https://www.jianshu.com/p/104f9290af8b] Seurat绘图函数总结 在使用R语言进行单细胞数据...
