概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也称主分量分析，旨在利用降维的思想，把多指标转化为少数几个综合指标。 在统计...
发简信
IP属地：广东
-
群体结构——PCA分析 -
学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
-
从统计学的角度理解RNA-seq这次是分享李婧翌团队的一篇综述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
-
群体进化选择消除分析要做选择性消除分析，首先就要把如下的理论记住熟记于心。 中性进化假说： 分子水平上，生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的，而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引...
-
D 统计量检测遗传渗入ABBA-BABA test ABBA-BABA 统计（也称为 D 统计）为严格二叉进化历史的偏差提供了一种简单而强大的测试。 因此，它们经常用于使用基因组规模的 SNP 数...
-
TPM、RPKM与FPKM相互转换
RNA 数据下载后，如果处理成read counts matrix的话，是一定要进行基于基因长度的标准化的（TMP，RPKM，TPKM等）。目前最常用的是TPM，网上已经有很...
-
2020-01-23 RSEM转录组RNA-seq测序分析实操测序数据的质控和过滤 见上一篇论文 https://www.jianshu.com/p/0a8461b1ea7a[https://www.jianshu.com/p/0a84...
-
如何使用KAAS进行KEGG注释使用KAAS做KEGG注释 标签： KEGG， RNAseq， bioinformatics 什么是KEGG 中文名: 京都基因与基因组百科全书外文名: koyto Ency...
-
使用snpEff对VCF进行注释
使用snpEff分为两种情况，一种是snpEff已经构建了相应的数据集（例如人类和小鼠），另一种是则是snpEff未提供相应的数据集（例如自己组装的基因组） 情况1: 我们可...
-
生信log18|一个上传基因组到NCBI的图文详细教程开篇废话一下：> 这篇日志分享的实际上是我总结了NCBI基因组上传流程并分享给组内同学参考的PPT教程，当然我们PPT上面还有16S rRNA基因的上传教程，因为是师兄做的，...
-
-
CFVisual绘制Motif+基因结构+结构域+进化树+启动子图的单独或组合图1. 软件简介 CFVisual_V2.1软件是一款借助Python语言的matplotlib库和PySide2库进行生物序列结构绘图的数据可视化软件，主要用于生物信...
-
转座子分类软件deepTE简介
作者：May审稿：童蒙编辑：amethyst 前言 基因组转座子（TE）注释过程中，对于RepeatModeler这种denovo注释的得到的转座子往往不能进行分类，因此对T...
-
寻找R gene三种方法之RGAugury特别感谢卖萌哥[https://www.jianshu.com/u/77fc519c6fa2]对于R gene的资源分享和指导帮助 参考文献：RGAugury: a pipe...
